Marko Ivan Rupnik se je rodil 28. novembra 1954 v Zadlogu pri Črnem Vrhu nad Idrijo. Leta 1973 je vstopil v Družbo Jezusovo. V Ljubljani je študiral filozofijo, potem pa se je leta 1977 vpisal na likovno akademijo v Rimu. Sledil je študij teologije na Papeški univerzi Gregorijani v Rimu. Leta 1985 je bil posvečen v duhovnika in istega leta začel specializacijo iz misijologije, prav tako na Gregorijani. Od leta 1987 do 1991 je živel v Gorici, v jezuitskem centru »Stella Matutina«, kjer je deloval predvsem med mladimi. Leta 1991 je pod mentorstvom p. Špidlíka dosegel doktorski naslov na Fakulteti za misijologijo na Gregorijani, in sicer z disertacijo: Teološko-misijonski pomen umetnosti v esejih Vjačeslava Ivanoviča Ivanova.
Od leta 1991 živi in dela v Rimu kot direktor Centra Aletti. Vrsto let je poučeval na Papeškem vzhodnem inštitutu, na Papeški univerzi Gregorijani in na Papeškem bogoslužnem inštitutu sv. Anzelm. Predavanja in seminarje ima še na mnogih drugih evropskih akademskih inštitutih. Od leta 1995 vodi tudi Atelje duhovne umetnosti Centra Aletti. Od leta 1999 je svetovalec Papeškega sveta za kulturo.
Leta 2000 je za mozaično poslikavo kapele Odrešenikove matere prejel Prešernovo nagrado.
Leta 2002 je od Milana Kučana, tedanjega predsednika države, prejel »Častni znak svobode Republike Slovenije« za prepoznavnost slovenske likovne umetnosti v svetu.
Leta 2003 je za svoje umetniško delovanje v Evropi prejel mednarodno nagrado »Beato Angelico« za Evropo.
Poleg umetniškega in teološkega dela se ves čas posveča tudi pastoralnemu delu, predvsem kot voditelj številnih tečajev in duhovnih vaj.

Knjige p. Rupnika v slovenskem jeziku:
- V plamenih gorečega grma, Ljubljana 1995.
- Božične pridige, Koper 1998 (več avtorjev).
- Vrgel se mu je v objem, Koper 1999.
- Brate iščem, Koper 2000.
- Reči človek, Koper 2001.
- Razločevanje. Prvi del: Doseči okušanje Boga, Ljubljana 2001.
- Razločevanje. Drugi del: Kako ostati s Kristusom, Ljubljana 2002.
- Pričevanje svetih ikon, Koper 2002 (več avtorjev).
- Barve sojnosti, Koper 2003.
- Spraševanje vesti. Da bi živeli kot odrešeni, Ljubljana 2004.
- Pri mizi v Betaniji, Ljubljana 2005.
- Boguljubove povesti, Koper-Ljubljana 2007.
- Pot krščanske poklicanosti, Ljubljana 2008.
- "Gledali bodo vanj, ki so ga prebodli", Koper 2009.
- Mozaiki Božje Matere, Koper 2009.